GPC 色譜柱以苯乙烯- 二乙烯基苯共聚物為填料的有機相凝膠柱，尺寸排阻分離模式，適合進行有機溶劑系的有機物、低聚物的分離，對高分子物質的分子量分布測試也很適用。
但是在使用過程中難免會出現故障，以下是出現常見故障之后的解決辦法。
校正曲線注意事項
曲線擬合形狀通常選擇五次方擬合。近幾年的研究表明，對校正GPC柱來說，這種擬合方式被認為是較好的，因為它很接近柱子的實際情況，標曲點數少于10個可以選擇三次方擬合。
聚合物樣品制備注意事項
聚合物溶液越稀越好，這樣可以防止粘度效應和保留時間不重現的現象。稀溶液可以允許聚合物充分展開，進入最松弛的構造，無鏈糾纏，不形成微膠。進樣體積：小于100 μL/每根色譜柱(7.8 mm ID)。
做GPC的流動相要盡量使用色譜純試劑，其他能過濾的溶劑或液體盡可能過濾；在有柱子的時候盡量不要把氣泡帶進。
■ 使用THF時：
需要注意溶劑中水含量及過氧化物的含量。水和過氧化物含量過高，會降低色譜柱壽命和結果的重現性。新購買的THF通常含有穩定劑(抗氧劑)，這種THF經過濾即可使用。抗氧劑的存在可以抑制THF中過氧化物的可能生成，從而減少過氧化物對系統的可能侵害，延長密封墊壽命。
■ 使用DMF時：
有時需要添加50 mM的LiBr以消除電荷效應，并且要嚴格除水。
■ 使用氯離子體系時：
由于氯離子對管路有腐蝕作用，因此需要將管路鈍化。
■ 水相GPC體系：
鹽也可以用于水相GPC，因為色譜柱中的甲基丙烯酸凝膠帶有負電荷。由于填料帶有負電荷會與陰離子樣品發生離子排斥，與陽離子樣品發生離子吸附。使用鈉鹽，可以大幅度減小這些影響，以及當與陽離子樣品發生任何離子交換作用時減少對洗脫液pH值的調整。
