使用氣體過濾器是為了盡可能地去除載氣或檢測器用氣中的雜質。對于GC 系統，氧氣、水分和烴類過濾器是zui多也是zui常用的氣體純化裝置。將單個的過濾器組合使用，就可以有效地去除氧氣、水分和/ 或有機物。雜質含量地降低能有效地延長色譜柱的使用壽命，提高分析的靈敏度。氣體質量的改進依賴于初始氣體的質量。使用很高純度氣體（如超高純度或相近級別的氣體）與較低級別的氣體相比，改變就較為明顯。
持續地使色譜柱處在有氧氣和水分的環境中，特別是在較高溫度下，這樣會嚴重快速地損壞色譜柱。而使用氧氣和水分過濾器會延長色譜柱的使用壽命。在接近或達到色譜柱的溫度上*，固定相會快速地降解或被破壞。在這種狀態下使用氣體過濾器，就會延長色譜柱的使用期限。有一些色譜柱的固定相極易被氧氣破壞。如果氣體鋼瓶本身或其周圍有泄漏，使用過濾器就能zui大限度地保護色譜柱不受影響。任何由于泄漏而進入氣流中的水分和氧氣都會被過濾器濾去，直至過濾器的容量達到飽和。這樣使得我們既能及時地發現和解決問題，又盡可能的使色譜柱不受損壞。
水分過濾器
指示型水分過濾器外部通常使用塑料或玻璃材質。當污染物有可能通過塑料滲透至過濾器內部時，我們使用玻璃體過濾器。玻璃體過濾器的外部一般也有一層保護，如塑料收縮包裹或在過濾器外部配置塑料防撞外套。玻璃和塑料體過濾器可耐壓150 psi，安全性足以滿足大多數的GC 試驗要求。
氧氣過濾器
氧氣過濾器通常是填裝有惰性物質（過濾介質）的金屬容器。大多數的過濾器可以將氣體中的氧氣濃度降至15-20 ppb。標準氧氣過濾器的過濾容量大約為30mg/100 cc 過濾介質體積。氧氣過濾器可去除氣流中的小分子有機物質和硫化合物。
我們一般推薦使用金屬體（通常為鋁）過濾器。使用塑料材質會導致外部空氣的滲透，進而污染過濾介質，使載氣質量有所下降。另外，金屬體氧氣過濾器耐高壓（至2000 psi），一定程度地保證了實驗的安全性。氧氣過濾器也可以去除氣流中的水分，但這并不會影響氧氣的過濾體積。
當氣體中的氧氣達到有害程度時，指示型氧氣過濾器就會變色示警。指示型過濾器并不能代替初始級的通用氧氣過濾器，當初始氧氣過濾器的過濾容量達到飽和而需更換時，指示型過濾器就會有所表征。指示型過濾器通常安裝在氣路中初始氧氣過濾器的后面。達到飽和的氧氣過濾器要立即更換，否則會使氣體受到污染。較大尺寸的指示型過濾器對氧氣的容量也只有中等水平，所以在它的前面安裝常規大容量氧氣過濾器做為初始除氧裝置。
烴類過濾器
烴類過濾器只能去除氣流中的有機烴類化合物。吸附劑通常采用活性碳或碳基質過濾介質。碳可以去除氣體中的，包括幾乎所有實驗室中可能用到的典型有機溶劑。毛細管級的烴類過濾器預先用超高純度氦氣凈化，填裝的是活性碳基質。過濾器的外體一般采用金屬基質，不使用可能會導致碳介質被污染的塑料材質。大多數的過濾器在失效后都可以重新填裝。
氣體過濾器的安裝
過濾器安裝的位置和數量由所使用的GC 系統而定。通常采用兩種方式。一種方式是將過濾器安裝在主氣路管線上（氣源后），在其后，氣路管線再分至每一臺GC。所有的GC 都使用同一個（套）過濾器。另一種方式是在每一臺GC 前安裝一套過濾器，也就是說每一臺GC 都有屬于自己的一套過濾器。
對于多GC 系統，如果不需要為每一臺GC 安裝一套過濾器，那么就將過濾器安裝在主氣體管線中，使其服務于所有的GC。此時，使用大容量過濾器，以降低濾器的更換頻率。以這種方式安裝的系統，在需要更換濾器時，要將所有被連接的GC 關閉離線。因為過濾器的多數費用決定于它的固定部件（如外殼等），所以使用大容量的濾器要比用小容量的節省花費。過濾器必需垂直放置。如果系統安裝了多種過濾器，其排列順序為1) 水分過濾器，2) 烴類過濾器，3) 高容量氧氣過濾器，4) 指示型氧氣過濾器。使用的種類和數量要依據實際情況而定。
如果對每一臺GC 都安裝一套過濾器，濾器安裝的位置離GC 越近越好。而對于這種安裝方式，能夠使用卡套式多種過濾的小型裝置，卡套式過濾器可以簡單方便地手工安裝或更換。面板可以放置在操作臺上或安裝于墻面上。由于面板上的卡套式濾器極易拆卸或更換，所以對于不同的實驗要求，可使用不同的過濾器組合方式。
如有可能，先將過濾器用氣體進行吹掃清洗。一般建議使用超高純度氦氣對過濾器進行預處理。有些濾器需要連續清洗好幾天，才能*清除吸附劑中留有的雜質。檢測器對載氣組成的變化或載氣本身都會有明顯的響應。使用未清洗的過濾器，基線通常會出現不穩定或漂移現象。
