下面是選擇離子對試劑的步驟
選擇一支柱子，通常是端基封尾的C18柱（Diamonsil）
使用色譜純的水和試劑
選擇獲得*分離效果的流動相的配比
如果樣品中含有非離子組分，在進樣前需*化樣品溶液
選擇合適的對離子，酸性化合物選用Q系列試劑，堿性化合物選用S系列試劑
選擇合適的碳鏈長度，使分離度達到zui大（圖2）
一旦選定離子對試劑，可以通過調整pH值來獲得*分離。
由于pH值能夠顯著影響保留時間，所以在調整時，應該微調，不可調整幅度太大。離子對試劑在流動相中的理想濃度通常是0.005M，但是也可以通過調整其濃度的大小來優化分離效果（表2）。
